Экологическое образование Челябинского государственного университета берет свое начало с 1996 года, когда на базе химического факультета открыли подготовку специалистов-экологов.
Создание факультета экологии связано с нараставшими экологическими проблемами Южного Урала, которые требовали решения. У истоков стояли: первый декан, кандидат технических наук, доцент Сергей Агеев, специалист в области техногенных систем и их взаимодействия с окружающей природной средой, проблем переноса энергии, массы, импульса в сплошных динамических системах; первый заведующий кафедрой экологии, кандидат геолого-минералогических наук Леонид Гайдученко; заведующий кафедрой природопользования, доктор геолого-минералогических наук, профессор Николай Плохих, инженер-геофизик, академик Международной академии наук экологии и безопасности жизнедеятельности, академик Российской экологической академии; заведующий кафедрой геоэкологии, доктор сельскохозяйственных наук, профессор Георгий Панов и другие.
Преподаватели факультета являются ведущими экспертами по вопросам экологии и природопользования и входят в общественные и научно-технические советы министерств и ведомств Челябинской области.
Среди известных ученых факультета: Александр Левит, автор известных книг, посвященных охране природы Южного Урала, основатель детско-юношеского геологического движения в Челябинской области; Людмила Мискина, член Совета ветеранов труда ЧелГУ, активно занимается профориентацией; Василий Синявский, ведущий специалист в области почвоведения, много лет посвятил изучению проблем сохранения плодородия почв в условиях интенсивного антропогенного воздействия.
За 20 лет факультетом подготовлено более 600 специалистов, которые работают на промышленных предприятиях, государственных структурах, музеях, заповедниках, научных организациях и других.